Η Μαργαρίτα Γερούκη είναι μάχιμη εκπαιδευτικός από το 1993, με Μεταπτυχιακές, Διδακτορικές, Μεταδιδακτορικές σπουδές στην Εκπαίδευση, την Αγωγή Υγείας και τη Σεξουαλική Εκπαίδευση, στην Ελλάδα και τη Φινλανδία. Εκτός από την αρχική παιδαγωγική της εκπαίδευση, κατέχει Πτυχίο και Μεταπτυχιακό τίτλο στην Αγωγή Υγείας (Πανεπιστήμιο Jyväskylä Φινλανδίας), Διδακτορικό τίτλο στην Εκπαίδευση Εκπαιδευτικών και τη Σεξουαλική Εκπαίδευση (Πανεπιστήμιο Helsinki Φινλανδίας) και Μεταπτυχιακό τίτλο ειδίκευσης στην Πολιτική Θεωρία και τα Ανθρώπινα Δικαιώματα (Πανεπιστήμιο Κρήτης). Έχει δημοσιεύσει επιστημονικά άρθρα, βιβλία και δύο παραμύθια. Έχει παρουσιάσει την επιστημονική της εργασία σε συνέδρια στην Ελλάδα και στο εξωτερικό. Συμμετέχει επίσης σε ευρωπαϊκά ερευνητικά και εκπαιδευτικά προγράμματα. Τα κύρια ερευνητικά και παιδαγωγικά της ενδιαφέροντα αφορούν στην ολοκληρωμένη σεξουαλική εκπαίδευση, την προστασία από τη σεξουαλική κακοποίηση, την πρόληψη της ενδοσχολικής βίας και την κοινωνική δικαιοσύνη. Το πρόγραμμα σεξουαλικής εκπαίδευσης «Παίζω με τον Φρίξο» στο οποίο ήταν η επικεφαλής συγγραφέας, έχει αποσπάσει το βραβείο Αριστείας και Καινοτομίας Προγράμματος Σεξουαλικής Εκπαίδευσης (2019) από την Παγκόσμια Ένωση για τη Σεξουαλική Υγεία (WAS).

Η Δρ. Γερούκη συμμετέχει ενεργά στη δημόσια σφαίρα μέσα από δράσεις της Κοινωνίας των Πολιτών, ως πρόεδρος του μη-κερδοσκοπικού οργανισμού ΑΞΕΠΤ (Ασφαλή Ξένοιαστα Παιδιά Τώρα), ως δημόσια ομιλήτρια, σχεδιάζοντας και υλοποιώντας εκπαιδεύσεις, για θέματα σεξουαλικής και αναπαραγωγικής υγείας, ισότητας, κοινωνικής δικαιοσύνης, καταπολέμησης της έμφυλης βίας και της παιδικής σεξουαλικής κακοποίησης. Είναι, από το 2021, μέλος της Επιστημονικής Επιτροπής για τη Σεξουαλική Εκπαίδευση, της Παγκόσμιας Ένωσης για τη Σεξουαλική Υγεία (WAS).